Para construir un interactoma, ¿deberían cuantificarse todas las posibles interacciones proteína-lípidos?

¡Seguro!

Mientras estamos en eso, agreguemos todas las interacciones que Akshari Gupta mencionó, además de:

Proteína-metabolito (ya sabes, todos los pasos intermedios en cosas como la síntesis de aminoácidos)
Cation proteico (cationes divalentes, especialmente!)
ARN-ARN
ARN-ADN
ADN-ADN

También necesitaremos investigar todos estos grupos de interacción para cada tipo de célula diferente en múltiples puntos de tiempo de desarrollo, e idealmente en una variedad de condiciones ambientales.

Esto solo costaría entre 100 y 1000 veces el presupuesto anual de los NIH (por lo tanto, 3-30 billones de dólares) y generaría un conjunto de datos en el que la mayoría de los biólogos experimentales (¡como yo!) No confiarán debido a la falta de rigor demostrado por la mayoría de interacción de alto rendimiento, ¡pero aún podríamos decir que tenemos todo el interactoma mapeado! ¡Qué logro!

Idealmente, si.

Aunque es extremadamente difícil mapear y cuantificar todas y cada una de las interacciones entre cualquier par de biomoléculas, un interactoma completo para cualquier sistema dado incluiría las siguientes interacciones:

  • Proteína-proteína
  • Proteína-ADN / ARN
  • Proteína-lípidos
  • Proteína-carbohidrato
  • Interacciones genéticas (redes de interacción genética)