¿Tenía el antepasado común de la bruja y la lamprea una columna vertebral?

Yo diría que no. Ni la lamprea ni el pez bruja tienen vértebras, sino un tubo de cartílago que sirve para el mismo propósito. Esto sugiere que un descendiente de animales como la lamprea o el pez bruja desarrollaron huesos y vértebras rígidas.

Por otro lado, se pensaba que el pez bruja siempre había tenido ojos simples, los ojos de otros vertebrados evolucionaron a partir de ellos. Ahora parece que tenían ojos más complejos que perdieron su complejidad: anatomía pigmentada en ciclostomas carboníferos y la evolución del ojo vertebrado

Nuestros datos respaldan la hipótesis de que los ojos de halcón existentes son degenerados, no rudimentarios, que los ciclostomas son monofiléticos y que el vertebrado ancestral tenía un sistema visual funcional.

Supongo que esto podría significar que el simple halcón de cartílago podría ser una degeneración similar de las vértebras reales.