El ADN es una cadena de nucleótidos repetidos y cada nucleótido contiene una base; adenina (A), citosina (C), guanina (G) o timina (T). El ADN puede metilarse en las citosinas que se encuentran frente a una guanina en la cadena de ADN (en la dirección 5 ‘→ 3’). La citosina se convierte en metilcitosina y estos sitios de metilación se denominan sitios CpG. La metilación de estos sitios CpG puede alterar la expresión génica. Esto es parte del mecanismo de epigenética (los efectos genéticos que no están codificados en el ADN).
Las regiones del ADN con una alta frecuencia de estos sitios CpG se llaman islas CpG. Estos a menudo se encuentran en la región promotora de los genes, infiriendo que la metilación en estas regiones puede alterar la expresión génica. En la mayoría de los casos, la metilación de la isla CpG conduce a la inactivación del gen. Este estado de metilación puede transmitirse a las próximas generaciones y esta forma de herencia no mendeliana se llama impresión. En las células cancerosas hay genes de supresión tumoral que se inactivan por metilación de la región promotora. El envejecimiento también tiene un efecto sobre la metilación del ADN.
Para estudiar estos mecanismos epigenéticos y determinar los patrones de metilación en las regiones CpG, la PCR de metilación es una técnica que se puede utilizar. La PCR específica de metilación (MSP) implica un tratamiento de ADN con bisulfito de sodio. Este tratamiento convierte las citosinas en uracilo pero deja las metilcitosinas intactas. Luego se realiza una PCR en este ADN usando cebadores específicos de metilación (con complementación para metilcitosina) y cebadores específicos no metilados (con complementación para los residuos de uracilo convertidos). Usando un conjunto de estos cebadores, el ADN es “interrogado” y la amplificación muestra la presencia de metilación.
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Para obtener más información, lea: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/…
Secuenciación de bisulfito
