Resultados falsos
Por ejemplo, una persona estaba tratando de detectar la frecuencia de un polimorfismo genético particular en una población. Él / ella aisló el ADN genómico de la sangre por lo mismo. El aislamiento también había sido delegado a unos pocos internos. Cada interno manejaba 3–4 muestras a la vez. Debido a la inexperiencia y torpeza, el interno mezcla dos muestras diferentes que conducen a la contaminación. Tras la PCR, los genes se amplificaron y arrojaron resultados confusos. La muestra particular parecía heterocigótica en lugar de homocigótica como debería haber sido. Aunque la contaminación fue menor, la amplificación en PCR complicó los resultados. Este es un caso de contaminación de la muestra.
Si los tampones y las enzimas utilizados en la reacción están contaminados, es posible que ni siquiera se produzca la PCR.
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