Los antepasados comunes a menudo se excluyen de los árboles filogenéticos por dos razones principales:
1) No sabemos cuáles fueron los ancestros comunes .
Por lo general, solo podemos etiquetar los nodos terminales (hojas / puntas) de un árbol filogenético porque sabemos cuáles son esos organismos, y nuestras observaciones de esos organismos (rasgos, secuencias de genes, etc.) constituyen el conjunto de datos de entrada que nos ayuda a inferir el Árbol filogenético. El árbol luego nos ayuda a determinar cómo se relacionan esos organismos (por ejemplo, podríamos ver que los elefantes asiáticos están más estrechamente relacionados con los elefantes africanos que con los humanos), pero los nodos internos (“divisiones”) carecen de etiquetas porque simplemente representan puntos inferidos donde los organismos (o genes ) actuales se unen. Se debe hacer mucho trabajo adicional para inferir que un organismo extinto (a veces conocido solo a partir de datos fósiles) es el antepasado de múltiples organismos actuales.
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Vea la respuesta de Joseph Ahrens a ¿Cómo interpreta la ascendencia en los árboles filogenéticos?
2) El árbol filogenético no es necesariamente un “árbol de especies”.
Por razones prácticas, las filogenias se infieren usando observaciones limitadas sobre los organismos que estamos estudiando. Por ejemplo, uno podría construir una filogenia molecular de primates utilizando ADN de un solo gen (citocromo oxidasa, hemoglobina, etc.). El problema aquí es que las especies son genéticamente diversas, y los genes individuales comenzarán a divergir en una población mucho antes del evento de especiación real. Además, las filogenias de genes individuales (“árboles genéticos”) no siempre son congruentes con el “árbol de especies” general (debido a la clasificación incompleta del linaje), por lo que no siempre podemos saber si los nodos internos en nuestras filogenias representan explícitamente organismos ancestrales o ancestrales genes
Vea lo siguiente para más detalles:
¿Cuál es la diferencia entre un árbol de especies, un árbol genético y un árbol filogenético?
Nature Reviews Genetics (clasificación de linaje incompleta)
Gracias por la A2A