La respuesta de Alexis es correcta, aunque incompleta. La frecuencia de alelos solo le informa sobre cuán común es un alelo particular en un locus dado (que es el término técnico utilizado para describir la ubicación en un genoma donde reside un gen. Usamos el término locus porque ‘gen’ es un término demasiado genérico para ser útil para los genetistas de población; su significado puede ser ambiguo). Realmente no le informa sobre el nivel general de variación genética en un lugar determinado, ni sobre toda la población.
Una forma de hacerlo sería calcular la heterocigosidad en un locus. Esto se calcula como 1-SUM (P [i]), de modo que P [i] describe la frecuencia del alelo i-ésimo en ese locus. Si quisiera calcular la heterocigosidad sobre un genoma completo, entonces esto sería 1-SUMA (SUMA (P [i])), donde la suma interna está sobre todos los alelos en el locus dado, y la suma externa está sumando todos Los genes en el organismo.
Si desea resumir la cantidad de variación genética en un locus después de una sola generación sin operación de selección natural y con solo dos alelos y sus frecuencias de alelos donde se describen por las variables p y q de modo que p + q = 1, entonces la cantidad de variación genética en ese locus particular (coloquialmente denominado gen) sería p * q / n. Eso le daría la variación en la población en ese lugar. Sin embargo, en la práctica no conoce los valores exactos de p y q (e incluso si lo hiciera, es algo irrelevante porque cambiaría un poco todo el tiempo), por lo que toma una muestra de la población y calcula una estimación de p y q en base a los individuos muestreados. Si desea obtener una mejor estimación de pyq en la población, podría usar algo como el problema del Recolector de cupones para estimar la frecuencia alélica total en la población, dada la cantidad de alelos que ha observado y la cantidad total de muestras tomadas .
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También vale la pena señalar aquí que el tamaño de la muestra que usa para examinar a su población coloca un límite inferior en la frecuencia mínima de alelos que su protocolo de muestreo capturará efectivamente. Entonces, si tiene más de dos alelos en un locus dado, tendría que usar la ecuación multinomial para la varianza en lugar de la ecuación binomial para la varianza.
Creo que es correcto, o mayormente correcto. Ha pasado casi una década desde que hice genética de poblaciones.
