La huella digital de ADN generalmente se refiere a la tipificación de repetición en tándem corta (STR) de muestras de ADN para obtener un perfil de ADN.
El primer paso de la tipificación de STR es utilizar PCR (reacción en cadena de la polimerasa) para hacer suficientes copias de la muestra de ADN para el análisis, ya que la cantidad de ADN en la muestra original será demasiado baja para la detección.
Los procesos STR producen cadenas cortas de ADN que difieren en longitud. La longitud de esas cadenas debe medirse para determinar un perfil de ADN.
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La electroforesis en gel es una técnica utilizada para determinar las longitudes de los productos de PCR porque es capaz de separar las diferentes longitudes de los productos en función de sus tamaños (cuánto duran). Cuanto más larga es la cadena de ADN, más tiempo tarda en recorrer la longitud del gel.
La mayoría de los análisis de STR hoy en día se realizan mediante electroforesis capilar que utiliza un tubo capilar hueco lleno de un gel de polímero.