G. Harry Stine y muchos otros han respondido esta pregunta. No recuerdo sus palabras exactas, pero era algo así.
La validez del método científico no se basa en la creencia de que funciona. Se basa en evidencia de que funciona. O el agua es segura o te mata. Lo que crees es irrelevante.
Utilizamos el método científico porque funciona. Todas las oraciones en el mundo no podían detener la disentería. Notando que cuando pones tu agua potable aguas abajo de tus letrinas lo hiciste.
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Las sondas espaciales aterrizan en Marte y se sumergen en la atmósfera de Saturno porque los físicos aplicaron el método científico y descubrieron las leyes del movimiento y la gravitación.
La teoría evolutiva predice que si seguimos prescribiendo antibióticos para todo, surgirán superbacterias.
Adelante, intenta encontrar un enfoque del universo que tenga un mejor historial. La ironía es que si lo intentas, seguramente usarás el mismo método científico cuya validez cuestionas: encontrar evidencia, proponer una explicación.