Una de las desventajas de la investigación observacional se conoce como “El efecto Hawthorne”. El efecto Hawthorne es cuando la presencia de un observador cambia el comportamiento de los observados. Por ejemplo: los trabajadores de la fábrica notan que un psicólogo industrial-organizacional los observa y trata de entender la baja moral de los empleados. Los empleados están contentos de que sus inquietudes se aborden pronto y sean más felices sin ningún cambio en sus condiciones de trabajo.
Una segunda desventaja es la subjetividad del observador. El investigador observacional puede observar las interacciones y los comportamientos de las personas, pero no necesariamente las razones por las que se comportan de la manera en que lo hacen. Por ejemplo: un investigador puede observar a personas en un tren leyendo el periódico en lugar de hablar con otros pasajeros. El investigador puede decir que esto se debe a que el pasajero no está interesado en hablar con extraños porque el pasajero es tímido. Sin embargo, podría ser que la persona bajo observación esté muy involucrada en el editorial que está leyendo.
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