¿Qué gen (o secuencia de nucleótidos no trivial) tiene el mayor número de copias en la Tierra?

¡Qué buena pregunta! En lugar de tener una respuesta más sólida (ya que no estoy seguro de que haya una), me aventuraré a especular libremente.

En cuanto a un gen candidato: ¿Quizás la ATPasa de tipo F?

Para “secuencia de nucleótidos no trivial”: Esto es un poco más complicado, pero si se pudiera encontrar una secuencia de consenso de “origen de replicación” para cada organismo, luego agruparlos por similitud, habría un grupo más grande de secuencias idénticas ..

Dado que hay muchos cromosomas por organismo para procariotas y más de una secuencia de origen por cromosoma para la mayoría de los eucariotas, la abundancia de copias de estas secuencias probablemente sea muy alta en la Tierra. Aunque creo que la archea ganaría, dada la relativa abundancia de organismos y su tendencia a expresar múltiples ORI por cromosoma. Sin embargo, quién sabe, ya que tendría que reducirse al conjunto más abundante de secuencias idénticas .

La secuencia genética más común en los genomas es el triplete ATG, que se transcribe a AUG como codón de inicio para el ARN mensajero. Aunque hay posibles codones de inicio alternativos, alrededor del 83% de los procariotas usan AUG y en eucariotas no AUG es muy raro. Mi razonamiento para esta respuesta es que cada segmento de datos genéticos, sin importar cuán grande o pequeño, necesita un codón de inicio y de detención.

Podría haber optado por los codones de parada, pero los codones de parada alternativos se usan con mayor frecuencia. Sí, también hay “paradas ocultas”, pero esto requeriría un cambio de marco para ser el código idéntico.

Entonces, la adenina – timina – guanina es la secuencia de datos de ADN más común y su complemento adenina – uracilo – guanina es el más común en el ARN, junto con la poliadenilación utilizada para las paradas.

Si esto no llega a su definición de no trivial, elegiría una secuencia vital en bacterias, porque la coli es el más poblado de todos los organismos. Dos tercios de todas las especies en la tierra son bacterianas y un total de 10 a las 30 bacterias de poder existen vivas en la tierra. Se podría pensar que las criaturas multicelulares como nosotros serían mejores candidatos porque estamos formados por células, pero las bacterias aún superan en número a las células eucariotas.

Buscaría repetidores, pero las bacterias tienden a ser eficientes en sus genomas, a diferencia de nosotros, para bien o para mal.

Aproximadamente la mitad de todas las bacterias son de vida libre y cultivables, mientras que la otra mitad es patógena, simbiótica o de alguna manera parásita, que son aquellas bacterias que residen exclusivamente en los organismos huéspedes. Un buen candidato para la respuesta a su pregunta sería en ambos tipos de bacterias, particularmente en un conjunto de instrucciones genéticas que se han reducido a la necesidad de los huesos desnudos.

Iría con el genoma de Carsonella rudii, que es un genoma diminuto de 160 kbp. Este bit de datos genéticos sería un candidato probable como el más común en toda la naturaleza, aunque algunos de ellos tendrían que reservarse como únicos para la especie.

Pero, como todas las secuencias genéticas, todavía tienen codones de inicio. Sólo digo’.

Supongo que todos los genes “universales” asociados con el conjunto mínimo necesario para la supervivencia calificarían. http://genome.cshlp.org/content/ …

No estoy seguro de la respuesta, pero sospecharía firmemente que tendría que estar observando una secuencia bacteriana o viral, posiblemente uno de los genes del virus HTVC010P, que es un bacteriófago que infesta las especies más abundantes conocidas de bacterias Pelagibacter ubique en De hecho, es el virus más prolífico conocido, lo que hace que haya mucho.