¿Cuántos (epi) tipos genéticos (fenotipos) de neuronas hay en un cerebro de mamífero?

No parece haber habido un intento sistemático de encontrar un sistema de clasificación universal para todas las neuronas del cerebro, y no está claro que esto sea posible.

En términos generales, cada área del cerebro tiene su propia comunidad de neurofisiólogos que han intentado tener sentido a lo largo de las décadas de los tipos de neuronas que se encuentran en esa región. El trabajo más sistemático sobre la clasificación del tipo de neurona se ha realizado en la corteza cerebral, el hipocampo y el cerebelo. Aunque cada vez que se ha investigado un área del cerebro, se ha intentado caracterizar los tipos de neuronas que se encuentran allí.

La epigenética puede referirse a modificaciones sistemáticas del ADN, como la metilación de pares de bases, pero también puede referirse a cualquier cosa que impulse la diferenciación celular, que incluye cientos de mecanismos que aún no se han trazado completamente. Los factores que afectan la identidad celular incluyen la expresión génica a través de un ecosistema de promotores, potenciadores, silenciadores que interactúan, así como una red de procesos intracelulares y comunicación intercelular mediada por proteínas que controlan la expresión del receptor y los patrones de conexión neural. A diferencia de la secuenciación de genes, no se conoce una forma sistemática para clasificar todos los fenotipos celulares.

Incluso cuando se ha realizado un tipado neuronal extenso, no siempre está claro qué constituye un tipo único. Por ejemplo, en la corteza cerebral, hay células piramidales y células estrelladas espinosas (excitadoras), así como numerosas neuronas inhibitorias clasificadas por forma (cesta, candelabro, martinotti, ramo doble, …). Sin embargo, en la categoría de celda de cesta, hay divisiones grandes, medianas y pequeñas que pueden parecer arbitrarias. Otras veces, las neuronas se clasifican por capa cortical, por ejemplo, células piramidales de capa 4 (L4) frente a células piramidales L3. O en la corteza visual, L4A vs. L4B vs. células L4C. E incluso L4C_alpha vs. L4C_beta. Las células inhibidoras también se han clasificado por la expresión de proteínas (PV +, SOM +, VIP +, CR +, Cb +, CCK +, NPY +), o por propiedades dinámicas (estallido, tartamudeo, picos rápidos, picos regulares). Algunos dirían que hay más de 100 tipos diferentes de neuronas inhibitorias solo en la corteza cerebral, mientras que otros dirían que solo hay 10-15 tipos. [1] [2]

¡Incluso hay una pregunta abierta si existen tipos distintos! Puede ser que las propiedades neuronales se encuentren a lo largo de un continuo, con algunas células que expresan un poco más de esto y otras que expresan un poco más de eso. Al igual que con la raza en humanos, estos tipos solo se destacan cuando hay una mezcla mínima. Pero siempre hay excepciones, y si todos los tipos de neuronas cambian continuamente entre sí, ¿cómo se decide cuáles son las categorías correctas para poder contarlas? Después de todo, ¿cuántos tipos diferentes de humanos hay?

[1] Thomson AM, Lamy C (2007). Mapas funcionales de circuitos locales neocorticales. Frontiers in Neuroscience (http://scholar.google.com/schola…).

[2] Markram H, y col. (2004) Interneuronas del sistema inhibidor neocortical. Nature Reviews Neuroscience . (http://scholar.google.com/schola…)

Excepto los casos patológicos, todas las neuronas (y todas las células somáticas, incluso) de un individuo deben tener la misma información genética en el núcleo, en forma de ADN. El patrón de expresión génica es diferente: es decir, qué genes se copian como ARN (transcriptoma) y qué proteínas se hacen a partir de ese (proteoma).
Por supuesto, se pueden formar grupos de neuronas sobre la base del proteoma o transcriptoma, y ​​supongo que sería posible producir una estructura similar a un árbol (grandes grupos y subgrupos), pero no será como un árbol evolutivo (que es lo que supongo que quieres decir con árbol genético), ya que los enlaces no son el resultado de la evolución / herencia, sino de patrones de expresión.
Cómo ordenar los grupos sería, por ejemplo, un problema: si tomamos como ejemplo las variaciones en la expresión de dos genes, A y B, y consideramos que tenemos grupos con todos los patrones (A-noB, noA-B y AB ), no hay forma de saber qué grupo debe estar dentro de qué otro. Si considera que A es más importante, puede tener grupos grandes formados en base a A (noA y A, este último contiene A-noB y AB) pero esto es arbitrario. Por supuesto, con variaciones sobre la expresión de una gran cantidad de genes y con análisis informáticos, podría tener una base racional para la agrupación, pero creo que una jerarquía completa en forma de árbol necesitaría algunas decisiones arbitrarias.