¿Qué tan útiles son los estudios de asociación de genoma completo (GWAS)?

GWAS ha identificado muchos loci que están asociados con riesgos de enfermedades y otros rasgos genéticos. Puede consultar pubmed.com para ver la larga lista de publicaciones resultantes de GWAS. A veces, los estudios de GWAS pueden identificar loci que están estrechamente asociados con el riesgo de enfermedad. Desafortunadamente, con frecuencia los estudios de GWAS solo apuntan a unos pocos loci que aumentarían o disminuirían el riesgo de un rasgo en unos pocos puntos porcentuales. Tales resultados son extremadamente difíciles de interpretar: ¿qué significa si mi riesgo de alguna forma rara de cáncer aumenta de .5% a 2%? Esto no me motivaría a cambiar mi estilo de vida o ir al médico con más frecuencia.

Parte de la razón por la cual los estudios de GWAS no han estado a la altura de las expectativas es que muchos rasgos se expresarán en diversos grados según el entorno. Además, los científicos plantean la hipótesis de que muchas enfermedades comunes pueden ser causadas por mutaciones poco comunes, en lugar de las variantes comunes que se prueban en los estudios de GWAS.

NHGRI (Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano) tiene un sitio curado con estudios publicados de Genome Wide Association.
Catálogo de estudios publicados de la asociación del genoma completo
Tiene una tabla de búsqueda que incluye una fila para cada estudio y columnas para las razones de probabilidades y los valores p.

Un buen artículo que describe cuán predictivos han sido hasta ahora los resultados de los estudios publicados de GWAS, es el artículo de 2009 de Manolio “Encontrando la heredabilidad perdida de enfermedades complejas”
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/

Este artículo, frecuentemente citado, examina la cuestión de dónde reside la materia oscura para la heredabilidad en fenotipos comunes, dado que incluso los estudios de GWAS más exitosos solo han descubierto variaciones que representan como máximo el 50% de la heredabilidad (es decir, la degeneración macular relacionada con la edad), y a menudo mucho, mucho menos.

El cuadro de la Figura 1 ilustra dónde se supone que GWAS debe caer en el panorama de la utilidad.