En términos generales, sí, probablemente habrá un tamaño de molécula óptimo para la reticulación de dos moléculas cercanas o grupos funcionales. Pero esto dependerá tanto del tipo de reticulación que desee como del vinculador mismo. Si el entrelazador es demasiado corto, no podrá golpear grupos adyacentes. Si el reticulador es demasiado largo, es posible que no “encuentre” los dos grupos a los que desea apuntar (p. Ej., Desfavorablemente entrópicamente), o puede plegarse sobre sí mismo para formar un globo no reactivo (dependiendo de su solubilidad).
Si solo quiere alquilar (o acilar) el diablo de un objetivo, y no está tan preocupado por los residuos exactos o las bases que se golpean, el tamaño probablemente no importará, siempre que el conector sea lo suficientemente largo como para golpear Dos grupos reactivos.
Las biomoléculas tampoco son estáticas: una proteína típica o una molécula de ADN / ARN “respira” en solución, por lo que las distancias entre los grupos reactivos no serán constantes. Del mismo modo, las moléculas de reticulación no son lineales en solución, por lo que su tamaño predicho (basado simplemente en un dibujo lineal de la molécula) no necesariamente se corresponderá con su tamaño real o conformación.
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TL: Dr.: Si estuviera realizando un experimento de reticulación, haría / ordenaría un montón de moléculas de diferentes tamaños y diferentes grupos reactivos y vería cuál funciona mejor para mi aplicación. Pero usaría tamaños de molécula en el espacio predicho y más grande.
