Cómo comenzar con Quantum ESPRESSO y visualizar resultados en VMD

La mejor y más simple manera de iniciar cualquier paquete de software es seguir los ejemplos que se dan en la carpeta de ejemplos de la distribución (por ejemplo: espresso-5.1 / PW / examples folder) y leer la guía del usuario hasta cierto punto. Además, debe suscribirse a la lista de correo de ese paquete (generalmente, muchas preguntas que desea hacer sobre el software ya serán respondidas (¡varias veces!). Solo tiene que ver los archivos o escribir su pregunta directamente en Google) ) A través de la lista de correo puede interactuar muchas veces con los desarrolladores del paquete y, por lo tanto, la posibilidad de obtener la respuesta correcta en el momento correcto será alta. 🙂

En cuanto al caso particular de Quantum espresso, hay muchos archivos de tutoriales en su sitio web (Tutoriales – QUANTUMESPRESSO). Además, si solo desea saber qué describe cada palabra clave en el archivo de entrada, puede escribir la ” descripción de entrada ‘nombre ejecutable’ en google. Por ejemplo, para el ejecutable pw.x debe escribir “pw.x input description” y obtendrá este enlace: http://www.quantum-espresso.org/…. Para cualquier otra entrada, como dos.x, projwfc.x, pwcond.x, etc., solo tiene que seguir el mismo proceso.

Al llegar a la visualización, debe usar xcrysden en lugar de VMD. El formato es

xcrysden –pwi input.in O

xcrysden –pwo output.out

También hay una nueva GUI de QE. Pero, no estoy muy seguro de lo bueno / malo que es.

Espero que esto ayude 🙂

La sintaxis para QE es

pw.x file.out

No creo que pueda usar vmd para cargar la densidad de carga, pero puede visualizar las coordenadas atómicas usando el formato .xyz o POSCAR. Tendrá que leer sobre estos formatos, pero son bastante simples de usar. Por lo general, abro una copia del archivo .out con vi y lo edito para crear la sección con las coordenadas atómicas en formato .xyz. Puede haber una mejor manera, por supuesto.