La ciencia básica nos dice que en el ADN las purinas se emparejan con la pirimidina. ¿Qué determina la disposición de los nucleótidos en una cadena de ADN, por ejemplo, AGTTCC?

Los nucleótidos pueden organizarse en cualquier orden, y esa es una de las propiedades más importantes del ADN (y el ARN, para el caso). El orden es el “código genético” que se puede leer para formar todos y cada uno de los organismos de la Tierra. Sin embargo, no es aleatorio: el orden se basa específicamente en el ADN original del que se copia, para que los organismos puedan transmitir su ADN y las especies puedan ser consistentes. En raras ocasiones, las mutaciones pueden cambiar el ADN y crean discrepancias que impulsan la evolución (pero estoy divagando).

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Los nucleótidos están dispuestos en una hebra debido a su estructura. Un nucleótido de ADN consiste en una base nitrogenada (adenina, timina, citosina, guanina), un azúcar desoxirribosa y un grupo fosfato. El grupo fosfato del nucleótido 1 se une al carbono 3 ‘en el azúcar desoxirribosa del nucleótido 2, y el grupo fosfato del nucleótido 2 se une al carbono 3’ en el azúcar desoxirribosa del nucleótido 3, y así sucesivamente. Este enlace entre el fosfato y el azúcar se llama enlace fosfodiéster, y la relación entre el azúcar y el fosfato se llama “columna vertebral de azúcar-fosfato” del ADN.

Entonces, básicamente para conocer este tipo de secuencias, existen métodos de secuenciación de ADN. Al igual que, por ejemplo, el método de Sanger, en este método, el ADN extraído deseado se vierte en 4 pocillos separados, a cada pocillo se le agrega químico que contiene ddNTP. En cada pocillo se agrega ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTp. Y el pozo que contiene cualquier base ddNTP corta esa base en cada punto donde aparece.

La disposición de los nucleótidos es la base de la vida. No está, hasta donde sabemos, determinado por otra cosa que no sea el ADN original del que proviene. Cuando ocurren cambios (mutaciones) en la secuencia de nucleótidos, podría afectar los genes dentro del ADN. Estas mutaciones se han producido a lo largo de la historia y son la base de la evolución.

Sabemos que la disposición del nucleótido es antiparalela. La disposición del par de bases también es complementaria, es decir, donde tiene A en un lado, G estará en el otro lado. Las enzimas también ayudan en la determinación del arreglo. La prueba de ADN polimerasa lee la disposición, verifica si los pares de bases son correctos. La nucleasa Endo corta un par de bases incorrecto que está en el interior y facilita la reparación. la nucleasa Exo corta un par de bases incorrecto que está en el exterior y facilita la reparación