Las bacterias Archaea son extremófilos que viven en ambientes hostiles, como aguas termales y lagos salados, ya que se han encontrado en una amplia gama de hábitats, incluidos suelos, océanos, marismas y el colon humano, por lo que son ubicuos. También se encontraron en una amplia gama de ambientes altamente salinos, ácidos y anaerobios.
Los ejemplos de arqueobacterias incluyen los halófilos , los metanógenos y los termófilos . Las Arcahebacterias son organismos unicelulares que pertenecen al dominio Archaea. Una característica que todos tienen en común es la capacidad de prosperar en condiciones ambientales extremas que existieron hace varios miles de millones de años. Los halófilos se encuentran en condiciones donde el contenido de sal es alto. Esto incluye lagos y agua de mar. Los metanógenos producen metano y se encuentran en los intestinos de los rumiantes y en pantanos y plantas de tratamiento de aguas residuales. Los termófilos se encuentran en entornos con calor intenso, como en manantiales y cerca de respiraderos hidrotermales. Las arqueobacterias son similares a las eubacterias en que carecen de núcleo.
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