1. La dominación no ocurrió en todos los casos de caracteres contrastantes.
2. El tipo de herencia de fusión puede ocurrir en muchos cruces.
3. A veces, dos dominantes se unen para formar un dominio conjunto, por ejemplo, en la herencia del grupo sanguíneo (grupo MN).
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4. Interacción génica no alélica como epistasis, factores inhibidores, presencia de genes complementarios y factores aditivos, etc.
5. Vínculos entre diferentes genes.
6. No disyunciones (no separación de cromosomas homólogos) de cromosomas durante el tiempo de formación de los gametos (es decir, durante la meiosis).
7. Factor múltiple (gen), que puede ser o no alélico, para un solo rasgo (por ejemplo, color de la piel, altura y peso del ser humano) y su herencia.
8. Efecto pleiotrópico de un gen, es decir, un gen que influye en más de un rasgo.
9. Alelismo, es decir, la presencia de una serie de genes alternativos en un locus dado en un cromosoma.
10. Poder de penetración diferencial (completo o incompleto) y expresividad de un gen dado en un tiempo diferente.
11. Presencia de un gen letal, es decir, un alelo de un gen que hace que un organismo sea inviable.
12. Influencias ambientales diferenciales sobre el efecto genético de un fenotipo particular.
13. Genes ligados al sexo, es decir, los genes presentes en los cromosomas ‘X’ o ‘Y’.
14. Los efectos de posición del gen, es decir, un solo gen puede tener actividad o expresión diferencial en diferentes posiciones en un solo cromosoma.
15. Atavismo, es decir, un gen se expresa después de un largo período de no expresión debido a la presencia de diferentes efectos de enmascaramiento.
16. Presencia de fenocopia, es decir, la similitud entre el fenotipo de un rasgo de genotipo particular con el fenotipo de otro genotipo. Este fenómeno ocurre debido a las influencias ambientales o hormonales.
