No estoy exactamente seguro de cuál es el contexto aquí, pero trataré de adivinarlo.
Cuando realiza una alineación, los puntajes de las probabilidades de registro pueden usarse para determinar qué tan buena es su alineación. Típicamente, cuando se determina el puntaje de su alineación y este puntaje se compara con el puntaje de una alineación aleatoria. Esto se combina para darle puntajes de probabilidades de registro, lo que le dará una idea sobre las posibilidades de que su alineación sea mejor que aleatoria.
Este marco de puntuación de probabilidades de registro puede tener más sentido para los modelos de perfil oculto de Markov. Por esta razón, recomendaría buscar en el documento HMMER. Búsquedas HMM de perfil acelerado
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Explica su implementación de los modelos Profile Hidden Markov, que en mi opinión, es un marco más riguroso para las alineaciones de puntuación.
