Como dice Katie Bjorkman, la endogamia no reduce la variación genética. Pero las poblaciones endogámicas suelen ser menos genéticamente diversas debido al pequeño tamaño de la población.
Piense en su población de Mooselets con todas las combinaciones posibles de genes.
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Luego imagine que la próxima generación solo produce unos pocos descendientes. No habrá suficientes descendientes para que aparezcan todas las combinaciones posibles de genes. Incluso si hay tantos descendientes como combinaciones de genes, la posibilidad hará que algunos genes se vuelvan más comunes que otros.
Esta es la razón por la cual los emparejamientos de hermanos y hermanas se usan comúnmente para producir cepas de ratones genéticamente uniformes. En una población tan pequeña, la variabilidad genética se pierde muy rápidamente.
La endogamia también aumenta la proporción de individuos homocigotos en un gen dado. Para Mooselets, esto significa que la descendencia de hermano-hermana, o primos de apareamiento, es más probable que sean aa, bb, cc o dd.
Las poblaciones pequeñas necesariamente resultan en la endogamia porque, durante varias generaciones, todos se relacionan con los demás. Por lo tanto, la endogamia y la pérdida de variación genética generalmente ocurren juntas.
Es por eso que los guepardos están en problemas. El pequeño tamaño de la población ha llevado a una diversidad genética reducida.