Si suficientes pacientes con una afección (y parientes que no sufren) fueron secuenciados genéticamente con 23andme, ¿podría el análisis de datos ayudar a determinar una causa?

Para las enfermedades con un fuerte componente genético, es muy probable que la secuenciación de los genomas de los pacientes y sus parientes no afectados puedan ayudar a determinar la causa. De hecho, el Programa de enfermedades no diagnosticadas de los NIH descubrió recientemente la causa de una nueva enfermedad vascular al secuenciar los genomas de personas de las dos familias en los Estados Unidos con la enfermedad [1]. Los investigadores compararon el ADN de los hermanos afectados con el ADN de sus padres y también con el ADN de extraños no afectados para reducir la causa de este trastorno a un gen.

Tengo entendido que 23andme no secuencia tu ADN; utiliza SNP, que es una técnica ligeramente diferente [2]. Básicamente, 23andme tiene un chip con miles y miles de secuencias de ADN diferentes, y trata de ver si esas secuencias están presentes en su ADN. Los SNP no cubren todo el genoma. Algunas enfermedades pueden ser causadas por mutaciones que no están cubiertas por los SNP, por lo que comparar los SNP no sería informativo. Además, en otros estudios (no realizados por 23andme) que usan SNP para aislar las causas de enfermedades comunes, tienden a aparecer muchos falsos positivos, debido a los miles y miles de SNP en los chips.

[1] Comunicado de prensa aquí: http://www.nih.gov/news/health/f…, más información sobre el Programa de enfermedades no diagnosticadas aquí: http://www.genome.gov/27543153

[2] Si alguien de 23andme quisiera corregirme sobre sus técnicas, estaría muy agradecido.

Sí, definitivamente podría. 23andMe (compañía) ha demostrado que 23andWe, su novedoso programa de investigación dirigido por participantes, produce resultados que abarcan réplicas de hallazgos científicos previos, así como asociaciones recientemente descubiertas. Para obtener más información, consulte esta publicación de blog de junio de 2010: http://spittoon.23andme.com/2010

Como parte de 23andWe, 23andMe está ejecutando dos proyectos de investigación importantes dirigidos a la enfermedad de Parkinson y el sarcoma. 23andMe también ha obtenido una subvención de los Institutos Nacionales de Salud para evaluar la investigación basada en la web sobre la genética de la respuesta a los medicamentos: https://www.23andme.com/about/pr

Si bien es absolutamente cierto que los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) son solo una parte de la variación genética responsable (junto con el medio ambiente y otros factores) de causar la enfermedad, hay muchos ejemplos en los que se ha encontrado que los SNP tienen un efecto significativo sobre enfermedades y trastornos (p. ej., enfermedad de Alzheimer, fibrosis quística), respuesta a medicamentos (sensibilidad a la warfarina, eficacia de Plavix), etc.

A medida que el costo de la tecnología cae y la secuenciación se vuelve más asequible, 23andMe (compañía) seguramente la aprovechará para llevar sus esfuerzos de investigación más allá del genotipado.