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Inicialmente, pocos científicos habían planteado la hipótesis de que esta cresta, que se asemeja a una enorme cornamenta, podría haber apoyado una “vela de cabeza” de piel utilizada para la estabilidad en vuelo. Si bien no hay evidencia fósil de tal vela, los estudios han demostrado que un apego membranoso a la cresta ósea habría impartido ventajas aerodinámicas.
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Sin embargo, en la descripción real de los fósiles, el paleontólogo Christopher Bennett argumentó en contra de la posibilidad de una membrana o extensión de tejido blando a la cresta. Bennett observó que los bordes de cada punta eran lisos y redondeados, y no mostraban evidencia de puntos de fijación de tejidos blandos. También comparó el Nyctosaurus con los tapejaridos de cresta grande, que preservan las extensiones de tejidos blandos soportados por púas, y demostró que en esas especies, los puntos de unión eran obvios, con bordes irregulares donde ocurría la transición del hueso al tejido blando. Bennett concluyó que la cresta probablemente se usó únicamente para exhibición, citando estructuras similares en animales modernos.
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El estudio de 2009 realizado por Xing y sus colegas que probó la aerodinámica de la cresta gigante con una “vela de cabeza” también probó la aerodinámica de la misma cresta sin vela, y descubrió que no agregaba factores negativos significativos, por lo que una cresta sin vela de cabeza no tendría obstaculizó el vuelo normal.
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Es más probable que la cresta haya actuado principalmente para la visualización, y que cualquier efecto aerodinámico que haya tenido haya sido secundario. Bennett también argumentó que la cresta probablemente no era un personaje sexualmente dimórfico, como en la mayoría de los pterosaurios con cresta, incluido el Pteranodon relacionado, ambos sexos tienen cresta y es solo el tamaño y la forma de la cresta lo que difiere. Por lo tanto, los especímenes de Nyctosaurus aparentemente sin cresta probablemente provenían de subadultos.
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