Una teoría particularmente común a mediados del siglo XX es que el Evento Tunguska fue producido por la colisión de una pieza de antimateria con Siberia. La antimateria reacciona explosivamente en contacto con la materia, un kilogramo explota con la fuerza de una gran explosión termonuclear. La idea no era intrínsecamente inverosímil en ese momento.
En un examen más detallado, la teoría no funciona. La explosión parece haber ocurrido a un nivel relativamente bajo en la atmósfera, seis a diez kilómetros sobre el nivel del suelo. ¿Cómo podría una cantidad sustancial de antimateria penetrar tan profundamente en la atmósfera impregnada de materia? La supervivencia de una cantidad tan importante de antimateria en las proximidades de nuestro sistema solar también es un problema, ya que el viento solar en particular llena el espacio cercano a la Tierra con muchas partículas de materia. Las probabilidades no son muy probables.
El consenso actual parece ser que el Evento Tunguska fue causado por la explosión de un asteroide o un cometa con un manto pedregoso en forma de ráfaga de aire, hecho completamente de materia normal. Ahora se sabe que tales eventos de impacto ocurren con bastante frecuencia, aunque los tan grandes como el Evento Tunguska son relativamente raros.
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