¿Es el consenso de Kozak la equivalencia eucariota de la secuencia procariota Shine-Dalgarno?

Todas las respuestas escritas a continuación son absolutamente incorrectas y engañosas.

La secuencia Shine-Dalgarno en Prokaryotes es el lugar de aterrizaje del ribosoma. El ribosoma 30S aterriza en la secuencia brillo-dalgarno y escaneará a través del ARN para llegar al iniciador AUG. El iniciador AUG puede no estar inmediatamente después de la secuencia brillo-dalgarno.

En eucariotas, el reclutamiento de ribosomas es a través de 5 ‘cap al final del ARNm. Cap complementa la función de la secuencia brillo-dalgarno en los eucariotas (reclutamiento de ribosomas). Una vez que el ribosoma aterriza en el ARNm, escanea. durante el escaneo pueden aparecer muchos AUG diferentes. Pero la secuencia de consenso de Kozak guía qué AUG se usará como iniciador AUG.

Como excepciones, muchos ARNm eucariotas tienen AUG iniciadores que no se encuentran en el consenso de Kozak.

La secuencia consenso de Kozak contiene un codón de inicio, sin embargo, en caso de procariota, el codón de inicio es inmediatamente después de la secuencia de brillo dalgarno.
Ambos tienen el mismo propósito y están aguas arriba de la secuencia de codificación.

Sí, ambos son equivalentes. Pero hay alguna diferencia. Primero, ambos son sitios de unión a ribosomas en ARNm.

La secuencia SD es complementaria al extremo 3 ‘del 16S rRNA. Su secuencia de consenso es 5’-UAAGGAGG-3 ‘, seguida de un codón de iniciación, más comúnmente AUG.

El espacio óptimo entre la secuencia SD y el codón de inicio es de 8 nt, pero el inicio de la traducción se ve gravemente afectado solo si esta distancia se reduce por debajo de 4 nt o aumenta por encima de 14 nt.

La secuencia de Kozak es el contexto de secuencia preferido que permite una unión ribosómica efectiva en el sitio de inicio en eucariotas.

-6 -5 -4 -3 -2 -1 1 2 3 4

GCC A CC AUGG

Por lo tanto, redondee la metionina iniciadora ( AUG ), siendo la A en el -3 la más importante, y una purina en el +4, preferiblemente la G más próxima.

Hasta donde yo sé, son funcionalmente equivalentes. Lamentablemente, no puedo proporcionar mucha más información que eso. Sin embargo, supongo que podría haber algunas diferencias menores o funciones secundarias que podrían diferir.

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