¿Por qué no incluimos lípidos de carbohidratos junto con proteínas de ADN / ARN en bioinformática?

La respuesta corta es que son difíciles de medir de manera reproducible con alto rendimiento. La mayoría de los bioinformáticos ni siquiera consideran los niveles de proteínas por la misma razón: el análisis generalmente se realiza en la secuencia de ADN y ARN, así como en la abundancia relativa de varios ARN. Estos pueden determinarse de una manera muy reproducible con un rendimiento extremadamente alto utilizando tecnologías de “secuenciación de próxima generación” que siempre son cada vez más rápidas y baratas.

Eso no quiere decir que nadie esté estudiando las pequeñas moléculas de la célula. Hay un campo completo (llamado “metabolómica”) dedicado a medir este tipo de moléculas y comprender sus fluctuaciones. Algunos investigadores también integran estos datos con los datos de secuenciación de ADN y ARN para tratar de comprender mejor cómo los diferentes genes afectan el metabolismo de la célula.

Está claro que el ADN es una forma de información heredada. El ARN generalmente se hace por transcripción directamente del ADN, y las proteínas generalmente se traducen (pero no siempre) del ARN. Entonces, estos tres tipos de moléculas son moléculas claramente heredadas, portadoras de información, directamente heredadas en su forma de ADN.

Los lípidos de carbohidratos no son parte de esta transmisión evolutiva directa de información, se forman enzimáticamente en respuesta al contexto de las células que los producen. Por lo tanto, tienen un papel diferente en el organismo, y las reglas de la evolución se aplican a ellos indirectamente en lugar de directamente. No existe un equivalente a una búsqueda RÁPIDA de lípidos precisamente debido a esta diferencia, que los carbohidratos no están evolucionando directamente, moléculas que contienen información.

Dicho esto, existen enfoques de alto rendimiento para estudiar los lípidos; son parte de un campo emergente llamado metabolómica. Eso es apropiado, porque tales lípidos son moléculas metabólicas, no las moléculas evolutivas portadoras de información estudiadas en (bio) informática.