¿Son los cebadores moléculas de doble cadena? Si no, ¿cómo se forman los dímeros de cebadores en una reacción de PCR?

Los cebadores son moléculas cortas monocatenarias.

A veces, el cebador directo y el cebador inverso pueden tener algunas secuencias complementarias y pueden dimerizarse.

Posibles atenuadores : adelante + adelante, atrás + atrás, adelante + atrás

Este dímero tiene algunos salientes en los lados 3 ‘y 5’ que luego se extiende por la polimerasa en la reacción y forma una molécula bicatenaria. Esto puede continuar durante muchos ciclos y puede verse en un gel de agarosa. Un problema potencial con los dímeros de cebadores es que pueden competir con su plantilla de ADN por reactivos de PCR y puede terminar obteniendo una amplificación muy débil de su producto.

(Por Tzachi Bar – Trabajo propio, CC BY-SA 3.0, Archivo: Formación de dímeros de imprimación En.PNG)

Esta imagen muestra el aspecto general de los dímeros de imprimación en un gel de agarosa después de la tinción con bromuro de etidio.

(De Primer Design Cont. – PCR Gel, T7, y purificación del producto)