Comúnmente, la canalización se refiere al análisis de secuencia de datos, y es una serie de pasos bioinformáticos y herramientas / algoritmos que se utilizan para analizar los datos. Por ejemplo, si estamos considerando la secuenciación del genoma completo, habrá una tubería para el análisis de SNP (polimorfismo de nucleótido único), otra para CNV (variantes de número de copia), otra para reordenamientos estructurales, etc. Estas tuberías pueden tener pasos en común , por ejemplo, pasos de control de calidad para deshacerse de secuencias con altas tasas de error, y también un paso de alineación que significa alinear las secuencias con el genoma de referencia.
Existen canales para analizar muchas modalidades de secuenciación diferentes, como RNA-Seq, que secuencia el transcriptoma, o ChIP-Seq, que secuencia secuencias de ADN previamente inmunoprecipitados a través de anticuerpos contra un factor de transcripción, o modificadores de cromatina, por ejemplo. La lista es en realidad bastante larga. Consulte este sitio para obtener una lista bastante completa: http://omictools.com/sequencing-…
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