¿Cómo se obtienen cifras sobre el genoma de diferentes especies que son iguales en ciertas cantidades? ¿No es siempre diferente el genoma de todos?

En años más recientes, se ha vuelto mucho más barato secuenciar genomas enteros, o partes de ellos.

Cuando se secuencia un genoma, el investigador tiene acceso al patrón sin procesar, es decir, literalmente verán en la pantalla “AATGTGCATC”, etc. La secuencia está ordenada y organizada, con errores corregidos para una secuencia muy ordenada.

Cuando se hace eso, un investigador puede conectar múltiples secuencias en un programa de computadora que las comparará y dará un número de la cantidad de secuencia A que coincide con la secuencia B basada en algoritmos avanzados.

Secuencia A: AATGTGCATC
Secuencia B: AATGTTCATC

90% de similitud entre estas dos muestras. (Por supuesto, esta es una simplificación excesiva idealista, pero muestra de manera aproximada lo que está haciendo la computadora).

Y sí, el genoma de cada persona es diferente, pero si alineas cada cromosoma tuyo, mío y tu perro uno al lado del otro, tu genoma y el mío coincidirán más estrechamente que tu genoma y el de tu perro. Y hay MUCHO espacio para las diferencias. Dado que los humanos tienen más de 3 mil millones de pares de bases (una A, T, C o G), mi genoma puede tener 30 millones de diferencias con respecto al suyo y todavía seríamos 99% iguales. Los perros tienen unos 2.800 millones de pares de bases y tienen un 84% de similitud con nosotros. Eso significa que tienen alrededor de 480 millones de diferencias . Hay muchas diferencias, pero cuando observamos una secuencia con miles de millones de pares … son comparativamente muy similares.

Y sabemos que esto es cierto porque si lo deseamos, podemos leer cada A, T, C o G en la secuencia y alinearlas una al lado de la otra. Este proceso de comparación se ha realizado innumerables veces y forma la base de la filogenética molecular: la reconstrucción del árbol de la vida a partir de datos genéticos.

Aquí está el artículo de wikipedia para la secuenciación para más detalles: secuenciación de ADN
Aquí está el artículo de Wikipedia para la filogenética molecular para obtener más detalles: filogenética molecular
Los investigadores tienen acceso a muchos genomas diferentes y genomas parciales a través del intercambio: GenBank Home

La métrica de igualdad del genoma que mencionas es una de synteny. La evolución es un gran reciclador y muchas de nuestras funciones biológicas centrales están altamente conservadas a lo largo de millones de años y en especies altamente divergentes. Esta conservación a lo largo de grandes períodos de tiempo y nuestro conocimiento de la mutación puntual y las tasas de recombinación meiótica nos permiten estimar el tiempo de divergencia de antepasados ​​comunes. Una buena introducción a synteny está aquí: Synteny: Inferring Ancestral Genomes