¿Puede el Oxford Nanopore MiniON hacer una secuenciación completa del genoma?

Suponiendo que se refiere a la secuenciación del genoma humano completo, es técnicamente posible, pero no es práctico ni económico. Al menos todavía no (a principios de 2016). MinION es una plataforma en rápida evolución, por lo que es un poco difícil precisar las especificaciones de rendimiento. Pero si suponemos 1 Gb por celda de flujo a $ 1000 cada uno, un genoma 30X tomaría 90 corridas y costaría $ 90k. El equivalente en HiSeq X Ten de Illumina sería una fracción de una carrera y costaría ~ $ 1k. Incluso si hace la afirmación (completamente razonable) de que no desea pagar los $ 10 millones para comprar el HiSeq X Ten, puede externalizar su secuenciación por tan solo $ 1200 por genoma (en grandes volúmenes; tal vez alrededor de $ 1800 por un genoma único).

Una vez que ONT lanza completamente su próximo instrumento, el PromethION, las cosas pueden cambiar. Hasta entonces, el MinION no es práctico para la secuenciación del genoma humano completo.

Editar 7/2017:

Las cosas han cambiado un poco en los ~ 18 meses desde que publiqué esta respuesta. La salida de MinION ha mejorado bastante, ya que las ejecuciones de 5 Gb son relativamente rutinarias (y las ejecuciones internas en Oxford Nanopore alcanzan 15 Gb). Y los costos también han bajado. Cuando se compra al por mayor, las celdas de flujo pueden costar tan poco como $ 500. Así que ahora estamos hablando de ~ 20 celdas de flujo a $ 500 / ea por un costo de reactivo de ~ $ 10k. Todavía mucho más caro que Illumina, pero no tan alto como para estar fuera de su alcance si realmente lo desea. Y aunque la calidad aún no coincide con Illumina, las lecturas largas realmente pueden ayudar con el montaje y el mapeo de repeticiones y reordenamientos. El PromethION todavía no está totalmente disponible comercialmente: está en manos de unos pocos clientes, pero aún está en la fase de prueba.