Sinceramente, no te preocupes por eso.
Como Guarav alude, “satélite” es básicamente una terminología antigua que ha sido heredada.
Muchos de nosotros ni siquiera nos molestamos (o sabemos exactamente cómo) distinguir entre SSR, STR y VNTR en la actualidad.
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Steven toca el punto más importante: los SSR y los SNP son diferentes tipos de marcadores. Ahora, en este caso, las diferencias son importantes.
Los SSR se forman a partir del deslizamiento de replicación y tienen altas tasas de mutación. También se pueden identificar a partir de una única secuencia del genoma. Esto los hace útiles cuando solo tiene acceso a un genoma único, y cuando solo puede acceder a algunos loci. Pueden proporcionar una buena resolución para individuos / especies estrechamente relacionados. Entre sus principales problemas están que no son tan comunes como los SNP, sus modelos mutacionales no son claros (la longitud puede aumentar o disminuir), y debido a que son polimorfismos de longitud, técnicamente no están basados en secuencias.
Los SNP son muy comunes, están ampliamente distribuidos en todo el genoma y casi siempre son bialélicos; en otras palabras, están bien representados por el modelo infinitesimal de Fisher, que ofrece una serie de ventajas. Debido a que evolucionan más lentamente, son más confiables para escalas de tiempo más largas (y también por qué son bialélicos). Si tiene acceso a muchos SNP, generalmente son superiores (múltiples SNP compensan la falta de resolución debida). Sin embargo, el desarrollo de SNP requiere genomas de múltiples individuos, por lo que tradicionalmente tenían altos costos iniciales / de capital. Sin embargo, una vez establecidos, son más fáciles de usar y más fáciles de multiplexar.
Existen otros marcadores (por ejemplo, variantes de número de copias, reordenamientos, indeles), pero los SNP y SSRS son generalmente los que se usan, con los SNP que reemplazan básicamente los SSR cuando hay buenas plataformas disponibles. Los otros marcadores se vuelven más importantes cuando el objetivo es identificar mutaciones / variaciones causales, no solo marcadores estrechamente vinculados.