¿Cuáles son algunos trabajos clásicos en bioinformática y biología computacional que uno debe implementar para practicar?

Estos son 5 documentos que recomiendo comprender e implementar (incluso solo para ejemplos de juguetes) para obtener una buena práctica de Bioinformática:

1) Herramienta básica de búsqueda de alineación local

2) Exploración, normalización y resúmenes de datos de nivel de sonda de matriz de oligonucleótidos de alta densidad.

3) Alineamiento ultrarrápido y eficiente en la memoria de secuencias cortas de ADN con el genoma humano

4) El ensamblaje y la cuantificación de la transcripción por RNA-Seq revela transcripciones no anotadas y cambio de isoforma durante la diferenciación celular

5) El núcleo del espectro: un núcleo de cadena para la clasificación de proteínas SVM

Por razones de por qué creo que estos 5 artículos son los mejores, vea: Respuesta del usuario de Quora a ¿Cuáles son algunos de los artículos / artículos / libros más interesantes en el campo de la bioinformática / biología computacional?

Aquí está:

  1. Un método general aplicable a la búsqueda de sim … [J Mol Biol. 1970] (algoritmo Needleman-Wunsch).
  2. Identificación de subsecuencias moleculares comunes. (Algoritmo Smith-Waterman).
  3. Algoritmo rápido para predecir el s … [Proc Natl Acad Sci US A. 1980] (algoritmo Nussinov; solo porque he trabajado en este campo).