Sí, caerían exactamente al mismo ritmo (pero vea los matices a continuación). Esta es una manifestación del principio de equivalencia, que es fundamental para nuestra comprensión de la gravedad, y la razón por la cual la teoría de Einstein puede describir la gravedad como geometría pura.
La esfera más caliente sería un poco más masiva. Sus átomos estarían moviéndose rápidamente, y todo ese exceso de energía cinética contribuiría a la masa total de la esfera (esto es nuevamente ese famoso negocio [matemático] E = mc ^ 2 [/ matemático]). La esfera más caliente también puede convertirse en ligeramente más grande debido a la expansión térmica, pero dado que la pregunta especificaba una cámara de vacío, por lo que no hay resistencia al aire, el tamaño no hace ninguna diferencia.
Si dos objetos caen a velocidades diferentes en función de la composición del material, la temperatura u otras propiedades, la descripción geométrica de la gravedad fallaría. O más bien, aún podría usar geometría, pero se requeriría una geometría diferente para cada esfera. La razón por la que podemos describir la gravedad usando una interpretación geométrica universal única es que no hay diferencia en la velocidad a la que los objetos caen en un campo gravitacional.
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Por supuesto, es cierto que un objeto más pesado atrae un poco más a la Tierra. Y aquí es donde importan los detalles de este experimento. ¿Dejamos caer las dos esferas al mismo tiempo o realizamos los dos experimentos uno a la vez? Si los dejamos caer al mismo tiempo, seguirán trayectorias idénticas; la Tierra, mientras tanto, también se aceleraría hacia ellos como resultado de la gravedad combinada de las dos esferas.
Sin embargo, si realizáramos el experimento de uno en uno, la esfera más pesada atraería a la Tierra un poco más. Lo que significa que la Tierra se acercaría a esa esfera un poco más rápido; su intensidad de campo gravitacional en la ubicación de la esfera aumentaría un poco más rápidamente; entonces la esfera se aceleraría hacia la Tierra un poco más rápido. Por supuesto, a menos que las esferas en cuestión sean del tamaño de un planeta menor o algo así, estas diferencias serían imperceptibles. Entonces, en estos experimentos mentales, generalmente tratamos a la Tierra como un objeto fijo.
Actualización (en respuesta a los nuevos detalles de la pregunta): la energía térmica agrega energía de masa a las esferas. Puede aumentar el espacio entre las moléculas (como resultado de la compleja danza entre la energía cinética y potencial y la interacción con varias fuerzas intermoleculares), pero ese no es necesariamente el caso; recuerde que, por ejemplo, el agua se expande a medida que se enfría entre 0 y 4 grados centígrados. Pero nada de eso importa. El principio de equivalencia le dice que todos los objetos caen a la misma velocidad, independientemente de la masa. La fuerza de la gravedad viene dada por [matemática] F = GMm / r ^ 2 [/ matemática] donde [matemática] G [/ matemática] es la constante de Newton, [matemática] M [/ matemática] es la masa de la Tierra, [ matemática] m [/ matemática] es la masa del objeto, [matemática] r [/ matemática] es su distancia desde el centro de la Tierra. Según la segunda ley de Newton, también tenemos [matemática] F = ma [/ matemática] donde [matemática] a [/ matemática] es la aceleración. Iguale los dos, [math] ma = GMm / r ^ 2 [/ math] y [math] m [/ math], presente en ambos lados, se cancela; te queda [math] a = GM / r ^ 2 [/ math], que no depende de la masa del objeto que cae. La versión relativista de este argumento usa matemáticas más complicadas (ecuación geodésica) pero el resultado es el mismo.