En la naturaleza, ¿los organismos crean materiales a partir de otros organismos, como nosotros, como lo hacen los humanos, o los organismos solo fabrican materiales a partir de elementos químicos en bruto?

Ambos.

Los autótrofos, como las plantas, utilizan la energía del sol y los nutrientes del suelo para crecer. Ganan nitrógeno específicamente de las bacterias en el suelo, aunque las bacterias no son consumidas por la planta, por lo que no voy a contar eso.

Los heterótrofos, como los animales y los hongos, deben consumir otros organismos para sobrevivir. Por ejemplo, los conejos comen plantas y los lobos comen conejos. Los hongos, a pesar de parecer plantas, descomponen otros organismos, generalmente después de que han muerto, pero como un leproso puede decirte, a veces mientras están vivos.

En particular, tanto los autótrofos como los heterótrofos obtienen materiales en ambos sentidos. Aunque las plantas obtienen la mayor parte de su energía del sol y la atmósfera, también usan los restos descompuestos de otros organismos; compost. Además, aunque los animales obtienen principalmente energía al comer otros organismos, también obtienen materias primas de la atmósfera y el sol.

Ambos. Los heterótrofos hacen lo primero. Autótrofos a este último.