Con esos ejemplos que diste es prácticamente imposible. Esto se debe a que los organismos “complejos” de los que estás hablando son todos eucariotas. Basado en la teoría más ampliamente aceptada de cómo evolucionaron los eucariotas, las bacterias DEBEN haber estado presentes.
La endosimbiosis es la teoría de que todos los eucariotas se originaron de una procariota anaeróbica (no puede usar oxígeno) que absorbió una bacteria aeróbica (puede usar oxígeno). En lugar de ser consumida, la bacteria aeróbica se quedó adentro y proporcionó su exceso de energía (ATP) a su nuevo huésped y se convirtió en lo que ahora conocemos como mitocondrias. Lo mismo sucedió más tarde cuando este nuevo eucariota tomó una cianobacteria que eventualmente se convirtió en cloroplastos. Esto es muy importante porque la respiración celular que usa oxígeno es muy eficiente y es la razón principal por la que los eucariotas pudieron formar la vida compleja que vemos hoy.
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Sin bacterias = sin mitocondrias ni cloroplastos = sin plantas y animales. Incluso si ese primer procariota anaeróbico evolucionara completamente por separado de todas las demás formas de vida, sin las mitocondrias nunca sería demasiado.