¿Es posible que los organismos complejos evolucionen antes que los organismos simples a partir de puntos de partida separados, en lugar de ramificarse de un solo antepasado?

Con esos ejemplos que diste es prácticamente imposible. Esto se debe a que los organismos “complejos” de los que estás hablando son todos eucariotas. Basado en la teoría más ampliamente aceptada de cómo evolucionaron los eucariotas, las bacterias DEBEN haber estado presentes.

La endosimbiosis es la teoría de que todos los eucariotas se originaron de una procariota anaeróbica (no puede usar oxígeno) que absorbió una bacteria aeróbica (puede usar oxígeno). En lugar de ser consumida, la bacteria aeróbica se quedó adentro y proporcionó su exceso de energía (ATP) a su nuevo huésped y se convirtió en lo que ahora conocemos como mitocondrias. Lo mismo sucedió más tarde cuando este nuevo eucariota tomó una cianobacteria que eventualmente se convirtió en cloroplastos. Esto es muy importante porque la respiración celular que usa oxígeno es muy eficiente y es la razón principal por la que los eucariotas pudieron formar la vida compleja que vemos hoy.

Sin bacterias = sin mitocondrias ni cloroplastos = sin plantas y animales. Incluso si ese primer procariota anaeróbico evolucionara completamente por separado de todas las demás formas de vida, sin las mitocondrias nunca sería demasiado.

Los primeros rastros conocidos de la vida son los estromatolitos: “fósiles” de esteras bacterianas. Hay abundante evidencia de que la vida unicelular es la única forma de vida durante los primeros miles de millones de años en este planeta. Además, la vida compleja solo se hizo posible después de que se desarrolló una relación simbiótica entre las mitocondrias simples y sus huéspedes más grandes.

Un científico responsable probablemente no diría que su hipótesis no es posible, pero sigamos adelante y digamos que toda la información disponible apunta a que su hipótesis es falsa.

Es raro que un organismo complejo se vuelva más simple.

También podemos estar seguros de los estudios de ADN de que el punto de partida era algo simple, un procariota:

¿Posible? Seguro.

¿Probable? No.