Las secuencias homólogas se denominan homólogos y este término puede aplicarse tanto a genes como a proteínas. Los homólogos se parecen entre sí y parecen compartir ascendencia común, pero pueden mostrar o no la misma actividad. La homología implica que las secuencias comparadas divergieron en la evolución de un origen común. denotan genes que derivan de la misma secuencia ancestral.
Ortólogos versus paralogs: los ortólogos son genes correspondientes en diferentes linajes y son el resultado de la especiación, mientras que los parálogos son el resultado de una duplicación de genes. Esto a menudo tiene implicaciones importantes: si bien los ortólogos a menudo cumplen el mismo papel, los parálogos tienden a divergir en su función, por lo que la paralogía es un peor indicador de analogía funcional que la ortología. Los genes homólogos producidos por duplicación de genes se denominan parálogos. Los genes parálogos son genes homólogos que resultan de la evolución divergente de un gen ancestral común. Paralogous implica que la duplicación de genes y la divergencia ocurrieron dentro del mismo organismo / especie y la divergencia de la secuencia condujo a la divergencia de la actividad. Los parálogos tienen un origen homólogo pero actividades heterólogas. Entonces, los ortólogos son homólogos producidos por especiación. Cuando la especiación sigue a la duplicación y un homólogo se clasifica con una especie y la otra copia a la otra especie, la divergencia posterior de la secuencia duplicada se asocia con una u otra especie. Dichos homólogos específicos de especies se denominan ortólogos. Por lo tanto, los ortólogos son homólogos de la duplicación que precede a la especiación, seguido de la divergencia de la secuencia pero no de la actividad en especies separadas. Los ortólogos tienen origen homólogo y actividad homóloga.
Análogos: se dice que los genes o proteínas que muestran la misma actividad pero carecen de similitud suficiente para implicar un origen común tienen actividad análoga. La implicación es que las proteínas análogas siguieron vías evolutivas de diferentes orígenes para converger en la misma actividad. Por lo tanto, los genes o proteínas análogos se consideran un producto de evolución convergente. Los análogos tienen actividad homóloga pero orígenes heterólogos.
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Xenologs. {Los xenólogos son homólogos resultantes de la transferencia horizontal de genes.}
