BLAST (Herramienta de búsqueda de alineación local básica) es un algoritmo para comparar información de secuencia biológica primaria, como las secuencias de aminoácidos de proteínas o los nucleótidos de secuencias de ADN. Una búsqueda BLAST permite al investigador comparar una secuencia de consulta con una biblioteca o base de datos de secuencias e identificar secuencias de biblioteca que se asemejan a la secuencia de consulta por encima de un cierto umbral.
Hay diferentes tipos de BLAST disponibles según las secuencias de consulta. Por ejemplo, después del descubrimiento de un gen previamente desconocido en el ratón, un científico generalmente realizará una búsqueda BLAST del genoma humano para ver si los humanos portan un gen similar; BLAST identificará secuencias en el genoma humano que se asemejan al gen del ratón en función de la similitud de la secuencia. El algoritmo y el programa BLAST fueron diseñados por Stephen Altschul, Warren Gish, Webb Miller, Eugene Myers y David J. Lipman en los Institutos Nacionales de Salud y se publicó en el Journal of Molecular Biology en 1990 y se citó más de 50,000 veces.
BLAST es uno de los programas de bioinformática más utilizados para la búsqueda de secuencias. Aborda un problema fundamental en la investigación bioinformática. El algoritmo heurístico que usa es mucho más rápido que otros enfoques, como calcular una alineación óptima. Este énfasis en la velocidad es vital para hacer que el algoritmo sea práctico en las enormes bases de datos del genoma disponibles actualmente, aunque los algoritmos posteriores pueden ser aún más rápidos.
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En segundo lugar, la secuenciación de ADN es el mejor método para recolectar y almacenar las secuencias de moléculas de ADN en archivos de computadora. Proceso de determinar el orden preciso de los nucleótidos dentro de una molécula de ADN. Incluye cualquier método o tecnología que se utilice para determinar el orden de las cuatro bases:
a.) adenina
b.) guanina
c.) citosina
d.) timina
en una hebra de ADN.
La rápida velocidad de secuenciación alcanzada con la tecnología moderna de secuenciación de ADN ha sido fundamental en la secuenciación de secuencias de ADN completas o genomas de numerosos tipos y especies de vida, incluido el genoma humano y otras secuencias de ADN completas de muchas especies animales, vegetales y microbianas. .
