La replicación se lleva a cabo solo en la dirección 5 ‘- 3’ y no en la dirección opuesta. Y debido a la naturaleza antiparalela de las dos cadenas de polinucleótidos, no es posible que la enzima ADN polimerasa realice la adición de bases de nucleótidos en las dos cadenas a la misma velocidad.
El problema de orientación se resuelve mediante el bucle del filamento rezagado, en el que la replicación se lleva a cabo en pequeños segmentos conocidos como fragmentos de Okazaki . Un solo fragmento de Okazaki puede medir hasta 200 pb y requiere un cebador de ARN para la síntesis de cada uno de los fragmentos. Estos framgments son sellados por ligasa después de la sustitución de los cebadores de ARN por bases de ADN. Todas estas coreografías tienen lugar en la síntesis de ADN de la cadena retrasada por una sola razón, es decir, la enzima ADN polimerasa II cataliza la adición de bases solo en la dirección 5 ‘- 3’ y no de la manera opuesta. Entonces, la síntesis de ADN de cadena retrasada es de naturaleza discontinua.
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