Es el agregador de proteómica de Arabidopsis desarrollado por el Comité Directivo de Arabidopsis Multinacional (MASC). Para cualquier proteína de Arabidopsis , puede buscar toda la información disponible sobre su espectro de masas, sus modificaciones posteriores a la traducción, su localización subcelular y sus perfiles de órganos, es decir, toda la información básica que necesita para comenzar su investigación proteómica.
El número que ingresa al principio es el AGI : el dentificador A rabidopsis G ene I. Puede encontrar los AGI buscando en la Búsqueda de proteínas TAIR, o a través del sitio web.
Una vez que recupera, obtiene varias vistas. En la parte superior, tienes el nombre de la proteína. Debajo tienes una barra de escala y varias líneas de colores. La barra de escala es la secuencia de proteínas. El gráfico lineal es un gráfico de hidrofobicidad. Las barras de colores son varios péptidos, la leyenda se encuentra en el panel de la derecha. Ese panel es un panel de control, así que haga clic para extraer más información en la trama.
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Los cuadros a continuación le indican la ubicación de la proteína en la célula y los órganos. Para ubicaciones subcelulares, también se proporciona el método de detección; gris significa que es solo una predicción, verde es por sondeo fluorescente, rojo por datos proteómicos.
El cuadro final proporciona todas las fuentes de datos para que pueda obtener los datos sin procesar originales. Tenga en cuenta que dirá “Just Now”: Gator no utiliza datos almacenados en caché, sino que los recupera de las diversas bases de datos cada vez que realiza una solicitud, por lo que siempre es información actualizada.
