Sí, es posible hacer un átomo de hidrógeno donde el electrón y el protón no existían anteriormente. Es relativamente fácil hacer electrones (y positrones) a partir de cosas que no contenían un electrón (o positrón). Por ejemplo, si dos protones se chocan entre sí con alta energía, se creará una pulverización de partículas y, a veces, esas partículas contendrán electrones y positrones. El LHC, por ejemplo, colisiona protones a altas energías y la pulverización de partículas salientes creadas a veces contendrá electrones y positrones.
Es más difícil hacer quarks a partir de no quarks porque los quarks individuales no pueden aislarse debido al confinamiento del color (vea mi respuesta a Física de partículas: ¿Cuál es la energía de unión de gluones para protones y neutrones en términos simples?). Puede usar un electrón y un positrón para hacer un quark y un par anti-quark usando una reacción como esta: 
Pero tan pronto como el nuevo par [math] q \ bar {q} [/ math] intente separarse, se crearán pares [math] q \ bar {q} [/ math] adicionales entre ellos y, por lo general, terminará con un mesón y anti-mesón de algún tipo (que luego se descompondrá en otras partículas). Sin embargo, a veces tendrás suerte y obtendrás un protón y un antiprotón en el estado final. Por ejemplo, en 1981 en el anillo de almacenamiento de positrones de electrones y PETRA, se informó la producción de 8 pares protón-antiprotón en este documento: Producción exclusiva de protón-antiprotón en dos fotones … | INIS
Por lo tanto, podemos hacer que cada uno de los componentes de un átomo de hidrógeno “desde cero”, podamos hacer electrones a partir de colisiones de protones y podemos hacer protones a partir de colisiones de electrones (y positrones). Entonces, estos electrones y protones recién creados no habrían existido antes de que los hiciéramos y podrían formar un átomo de hidrógeno.
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