¿Cuál es la distancia genética típica (fracción de nucleótidos no idénticos) entre dos alelos del mismo gen?

Proporcione algunas aclaraciones / comentarios si mi aclaración está desactivada. Solo para que todos se refieran a la misma definición y pregunta, permítanme repetir la pregunta.

La distancia genética en este contexto es la medida de la relación entre dos poblaciones de frecuencias alélicas. Alelos que se refieren a la variación de un gen del gen predominante en una población.

La confusión es desde un par de perspectivas. Las frecuencias alélicas pueden ser más que solo 2 opciones, ya que podría haber múltiples versiones de un gen dentro de una población. Las otras líneas de confusión en que la pregunta parece querer extenderse a frecuencias alélicas también en múltiples loci.

La pregunta es preguntar cuál es la variación normal entre genes en cualquier loci dado con la esperanza de extender esto a la variación de múltiples loci.

El problema con la variación “típica” dentro de una población es una cuestión de tipo, así como sabemos que hay muchos tipos de mutaciones, siendo los SNP los más comunes. Nuevamente, esto depende en gran medida del contexto, ya que, por ejemplo, las bacterias frente a los humanos tendrán diferentes frecuencias de nuevos alelos que surgen en una población y una tasa diferente de fijación es una función del tiempo de generación y la tasa de mutación es la más básica. La complicación adicional surge del hecho de que con la tecnología actual es posible evaluar en todo el genoma cómo cambian las frecuencias alélicas que está relacionado con su comentario de múltiples loci.

Algunos artículos de revistas sobre E. coli

BMC Genomics

Variación en la virulencia entre clados de Escherichia coli O157: H7 asociada con brotes de enfermedades

Diversidad mutacional de todo el genoma en una población en evolución de Escherichia coli

Mi sospecha es que nadie tratará de evaluar la variación “típica”, ya que depende completamente del contexto biológico y es más probable que sea diferente en un contexto similar porque la ubicación de la variación depende del tipo de gen y la ubicación de la variación. .