¿Los árboles con amentos y flores de cono hembra (ej. Aliso) están evolutivamente cerca de los pinos?

Esta es una suposición razonable, dada la semejanza. Sin embargo, no creo que sea la suposición correcta. Ahora, no lo sé con certeza, ya que no he estudiado formalmente la filogenia de las plantas, pero hay algunos hechos comúnmente conocidos que me permiten hacer una suposición educada que creo que será bastante cercana a la verdad.
Entre las plantas, las angiospermas (también conocidas como plantas con flores) se consideran las menos basales de los dos grupos principales dentro de las plantas productoras de semillas. Es justo decir que las angiospermas evolucionaron a partir de más plantas similares a gimnospermas. Ahora, entre las angiospermas, los magnoliides (magnolia, laurel, etc.) y Nymphaeales (nenúfares, lotos, etc.) son más basales que las monocotiledóneas o las dicotiledóneas, que incluyen todos los amentos. Parece haber una gran separación entre los amentos y las gimnospermas, por lo que su aparente similitud probablemente se deba a la evolución convergente. Esto tiene sentido si piensas un poco más sobre la morfología. Considera los robles. Realmente, solo las flores masculinas incluso se parecen a conos. Las estructuras florales femeninas son discretas en el mejor de los casos, y si las miras, se ven como … flores. Llevan bellotas individualmente. Tal vez en dos o tres como máximo. Fuera de los amentos, ninguna parte de la reproducción en roble se parece mucho a la gimnosperma típica. Sin embargo, compárelo con las magnolias y los lotos: ambos tienen estructuras leñosas complejas que sostienen múltiples semillas y persisten después de la dispersión. Esos se parecen mucho más a las piñas en comparación con cualquier cosa de las monocotiledóneas y dicotiledóneas, con la excepción de los alisos, el chicle y el sicómoro americano, que son los únicos ejemplos en los que puedo pensar que realmente tienen estructuras en forma de cono.
Dada toda esta información sobre la filogenética y la morfología básicas, creo que es razonable decir que los amentos no están significativamente más estrechamente relacionados con las gimnospermas que el resto de las angiospermas. Cualquier experto real, por supuesto, puede dar su opinión sobre el asunto.