¿Qué pasaría si un gran cometa se estrellara contra otro planeta como Marte y lo destruyera? ¿Tendría un efecto contrario en nuestro sistema solar?

Un cometa, incluso uno enorme, no podría “destruir” un planeta. No es lo suficientemente grande para eso. La mayoría de los cometas tienen entre 1 y 10 kilómetros de diámetro y si se trata de uno enorme, uno podría suponer que tiene quizás cien kilómetros de ancho. Considere esto con el tamaño de Marte (6,792 km) o incluso el planeta más pequeño de nuestro sistema solar (Mercurio): 4879 km. Claro, haría una gran abolladura, pero no destruiría el planeta. Esto no afectaría a nuestro sistema solar en su conjunto.
Ahora, a su pregunta (implícita), ¿qué pasaría si un planeta se “destruyera” y cómo se reflejaría en el sistema solar? Todos los cuerpos masivos (como los planetas) ejercen una atracción gravitacional sobre todos los demás. La remoción de Marte de su órbita ciertamente tendría algún efecto en el movimiento de la Tierra, pero sería bastante leve. La órbita cambiaría ligeramente y definitivamente no sería suficiente para echarnos de la “zona de Ricitos de Oro”. Sin embargo, durante largos períodos de tiempo (millones y miles de millones de años) el comportamiento dinámico del sistema sería diferente de lo que sería con Marte involucrado. Para los detalles de tal comportamiento necesitaría alguna simulación de computadora de alta potencia para predecir.