Su pregunta es realmente amplia … depende de lo que esté tratando de estudiar realmente. Si está tratando de hablar sobre proteínas, por ejemplo, diría que es bastante probable que la estructura se altere porque muchas cosas en su mezcla se cristalizarán cuando se caigan a una temperatura lo suficientemente baja y se les dé suficiente tiempo para nuclearse.
Con respecto a la composición química, creo que es probable que se conserve, ya que la congelación no generará una difusión significativa, A MENOS que se forme cristal macroscópico (en su caso, sería hielo saliendo de la mucosidad).
Cuando dice estructura química, esto me parece muy arbitrario, ¿pregunta si se conserva la morfología o si se conserva la estructura de enlace químico? Además, ¿estás hablando de moléculas pequeñas o moléculas polimerizadas grandes como las proteínas? Las moléculas pequeñas generalmente no se verán tan afectadas por el frío, sin embargo, las moléculas más grandes o las colecciones de moléculas como la proteína pueden alterarse significativamente con respecto a su forma aparente con cambios bastante pequeños en las condiciones.
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Desafortunadamente, no hay referencias, pero creo que también necesita formarse una mejor idea de lo que llamaría “estructura química preservada”. Limite qué especies químicas le interesan preservar y qué necesita en particular preservar de ellas. Lo que intenta descubrir / medir determinará cuándo algo se “conserva lo suficiente” para su estudio.