Creo que esta pregunta representa una confusión con respecto a la terminología.
En el lenguaje cotidiano, hablamos de la aceleración como un aumento en la velocidad y la desaceleración como una disminución en la velocidad.
Pero en realidad, en primer lugar, la velocidad es una cantidad vectorial: tiene una magnitud y una dirección.
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En segundo lugar, la aceleración de un observador es la desaceleración de otro observador: por ejemplo, cuando acelera su automóvil para alcanzar a un tren en marcha, para un observador en el tren, su automóvil parece desacelerar, hasta que coincida con la velocidad del tren, en ese punto su velocidad relativa al tren ha llegado hasta cero.
Por esta razón, los físicos llaman a cualquier cambio en la velocidad: aumento o disminución de la magnitud, o incluso un cambio en la dirección, aceleración.
Entonces, cuando lees que la aceleración de una carga es lo que produce fotones, esa oración en realidad significa que un cambio en la velocidad de la carga (su magnitud o dirección) puede resultar en la emisión (o absorción) de un fotón.