Supongo que su pregunta es con respecto a la situación durante 1908-1913 cuando se realizaron estos experimentos. Un buen resumen de los resultados se puede encontrar en este enlace de wikipedia [Experimento Geiger – Marsden – Wikipedia]. Por lo que entiendo, fue un proceso de deducción por Rutherford et al.
Rutherford había descubierto partículas alfa alrededor de 1899 y, por sus propiedades de desviación en un campo eléctrico, sabía que estaban cargadas positivamente. Entonces, cuando los pasó a través de delgadas láminas de oro (usando uranio para generar partículas alfa), tuvo que sacar conclusiones basadas en los resultados de estos experimentos. Los experimentos mostraron que:
- La mayoría de las partículas alfa pasaron sin ninguna desviación.
- Pocas partículas alfa fueron desviadas (en ángulos agudos) e incluso pocas fueron fuertemente desviadas (en ángulos obtusos).
Esto insinuó la posibilidad de un átomo que consta de un centro cargado y la carga opuesta que orbita el centro. Dado que solo unas pocas partículas alfa experimentaron una desviación, se puede deducir que cualquier partícula que orbita el centro cargado tiene una relación de masa a carga mucho menor que las partículas alfa. Curiosamente, Rutherford consideró la posibilidad de que el centro cargado pudiera ser negativo como se explica en este maravilloso artículo [Young Rutherford] (recomiendo leer las 5 secciones de este artículo). En este modelo, las partículas alfa se desvían utilizando un efecto de tirachinas como en los cometas alrededor del sol (esto se explica en el artículo anterior). Sin embargo, varias otras consideraciones, como la velocidad de las partículas alfa emitidas radiactivamente y la absorción de partículas beta por los átomos, llevaron a la deducción de que la carga central es positiva. Así llegó al centro con carga positiva y órbita de partículas con carga negativa.
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Ahora para responder a su pregunta, no es que Rutherford no haya considerado los electrones como obstáculos, es solo que su experimento sugirió lo contrario. Trató de explicar los resultados de sus experimentos creando un modelo teórico que explicaría los resultados. Ahora, como lo sugirieron los experimentos, el modelo tiene un centro de carga positiva y partículas cargadas negativamente en órbita. Además, como los experimentos sugieren que estas partículas en órbita cargadas negativamente deben tener una relación masa / carga realmente pequeña en comparación con las partículas alfa y, por lo tanto, no causarían mucha desviación.
