Escribo mis publicaciones (y escribí mi tesis doctoral) usando TeXworks para Linux. Antes de eso, utilicé la aplicación minimalista TeXShop (que, por cierto, fue la inspiración para TeXworks) en Mac. Ambos son bastante básicos, pero me gustan mis herramientas de esa manera. Mis amigos prefieren el más elegante TeXMaker.
Mi distribución preferida de LaTeX es TeXlive porque tiene todo menos el fregadero de la cocina. No recuerdo haber tenido que descargar un paquete nunca.
LaTeX tiene un buen manejo de notas al pie de página y bibliografía (a través de BibTeX). Nunca he usado Zotero pero entiendo que es compatible con el formato BibTeX. Uso Jabref como mi administrador de referencia (y está bien, pero carece de brillo). También usé Bibdesk cuando estaba usando una Mac y es excelente.
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Hay una pequeña curva de aprendizaje con LaTeX (que implica muchas maldiciones cuando el documento no se compila), pero para las publicaciones científicas, no puedo pensar en nada mejor. La asignación entre el código LaTeX y el documento compilado tiene la virtud de ser algo más predecible de lo que puede ofrecer una interfaz WYSIWYG.
Existe LyX, por supuesto, que es una excelente herramienta WYSIWYM para escribir documentos científicos, y funciona muy bien con documentos con matemática sin complicaciones. Sin embargo, me resultó difícil de manejar para escribir matemáticas que requerían paquetes especiales, TikZ, etc. (aunque sospecho que es solo porque no estoy acostumbrado a la interfaz)
Si no necesita hacer cosas complicadas, le recomiendo probar LyX. La sección / ecuación / numeración de capítulos, etc. por sí sola la hace preferible a Word, especialmente para escribir documentos científicos largos como tesis.
(He escuchado tantas historias de terror sobre Word que arruina los números de las figuras y el formato cuando se vuelve a fluir un documento enorme).
Y, oh, si eres un usuario de LaTeX y a menudo tienes problemas para recordar el código de LaTeX para símbolos particulares, este es un salvavidas:
http://detexify.kirelabs.org/cla…
Por ejemplo, a menudo uso este símbolo [math] \ succ [/ math] (para denotar “positivo-definido”) pero nunca puedo recordar su nombre LaTeX (\ succ, ¿qué significa eso?)
