Digamos que tienes 10 QTL.
Si solo tiene en cuenta las interacciones bidireccionales, tiene 10 opciones para elegir 2 combinaciones. ¡Son 45 interacciones bidireccionales! ¡Incluya interacciones de tres vías, y eso es otro 10 elegir 3 = 120 combinaciones! Cada combinación requerirá un grado de libertad para estimar. Incluya todo hasta interacciones de 10 vías y … bueno, ya tiene la idea.
En ocasiones, las interacciones bidireccionales se modelan y, por lo general, solo en QTL que ya se identificaron como que tienen un efecto significativo.
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La otra razón por la cual las interacciones no se miden es que no son útiles en algunos casos. La reproducción y la heredabilidad de sentido estrecho es un buen ejemplo. Solo los efectos principales pueden transmitirse de manera confiable a la próxima generación en muchos casos, por lo que no estamos tan preocupados por las interacciones.
Dicho todo esto, es una gran deficiencia en nuestros modelos GWAS (y por qué ignoro muchos de estos estudios). Este fue un trabajo que comparó varios modelos y concluyó que la epistasis domina la arquitectura genética de los rasgos cuantitativos de Drosophila. Básicamente, ninguno de los QTL en un modelo tradicional de solo efectos principales coincidía entre dos poblaciones muy grandes (pero diferentes). Sin embargo, aparecieron en modelos epistáticos.
