Las enzimas de restricción reconocen secuencias de ácido nucleico que comúnmente varían de 4 a 8 residuos. Dado que hay cuatro bases posibles (ACGT), las posibilidades de que una secuencia de cuatro aparezcan aleatoriamente son 1/256, de 6 son 1/4096 y de 8 son 1/65536. Si un vector típico tiene aproximadamente 5000 bases, entonces se esperaría que cualquier cortador de 6 apareciera aleatoriamente una vez, y un cortador de 4 en particular aparecería aleatoriamente unas 20 veces. Las bases no son completamente aleatorias, pero eso es más o menos lo que verá.
Probablemente subestimes en gran medida el número de sitios de restricción en un fragmento genérico de ADN, porque la mayoría de las personas que lo mapean no se molestarán en indicar los más comunes; los que aparecen docenas de veces, por ejemplo. Si tuviera que tomar su vector favorito y mostrarlo en cada sitio, sería negro con texto e ilegible, y estaría claro que tantos sitios no podrían tener funciones específicas.
En otras palabras: No, los sitios de restricción generalmente no tienen ningún propósito.
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