De wikipedia:
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Si bien los caimanes (y caimanes) a menudo se confunden con los cocodrilos, pertenecen a dos familias taxonómicas bastante separadas.
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Las diferencias externas más obvias son visibles en la cabeza: los caimanes y caimanes tienen cabezas más anchas y más cortas, y un hocico más en forma de U que en forma de V. La mandíbula superior del cocodrilo es más ancha que su mandíbula inferior, y los dientes en la mandíbula inferior encajan en pequeñas depresiones en la mandíbula superior. Las mandíbulas superior e inferior de los cocodrilos son del mismo ancho, y los dientes en la mandíbula inferior caen a lo largo del borde o fuera de la mandíbula superior cuando la boca está cerrada. Cuando la boca del cocodrilo está cerrada, el cuarto diente grande en la mandíbula inferior se contrae en la mandíbula superior. Para especímenes difíciles de distinguir, el diente sobresaliente es la característica más confiable para definir una especie. Sin embargo, en cautiverio, los caimanes y caimanes pueden mostrar deformidades de la mandíbula que resultan en protuberancias de los dientes inferiores.
Los caimanes carecen de la franja irregular que aparece en las patas traseras y los pies del cocodrilo y tienen los dedos de los pies traseros enredados, no más de la mitad de las puntas. Los cocodrilos prefieren el agua dulce, mientras que los cocodrilos pueden tolerar mejor el agua de mar debido a las glándulas especializadas para filtrar la sal. Sin embargo, ambos taxones pueden sobrevivir en cualquiera.
Ambas especies de caimanes también tienden a ser de color más oscuro que los cocodrilos, a menudo casi negros, pero el color depende mucho de la calidad del agua. Las aguas cargadas de algas producen una piel más verde, mientras que el ácido tánico de los árboles colgantes a menudo puede producir una piel más oscura.