¿Puedes usar una computadora para tomar ADN y descubrir cómo era la cadena antes de su última mutación? ¿Qué tan atrás podrías llegar con esto?

No estoy seguro de lo que está pidiendo el OP, pero dividiré la pregunta en estas dos partes:

  1. ¿Cómo determinaríamos qué era una secuencia de ADN ‘no mutada’ antes de que adquiriera una mutación?
  2. ¿Y cuántas veces hacia atrás en el tiempo podría determinarse esto?

Esto se hace comúnmente en la investigación del cáncer humano e incluso en la microbiología, solo como dos ejemplos. Lo que se necesita es una muestra de referencia, que representaría un tiempo antes de que ocurriera la mutación y la ‘muestra mutada’.

En el caso de la biología del cáncer, una muestra de ADN genómico somático (ADNg) del organismo es esa referencia. La muestra somática representa el genoma adquirido de los padres, lo que impediría cualquier mutación para ese individuo, a menos que la mutación también ocurriera muy temprano después de la fertilización y luego la embriogénesis. Al comparar las secuencias de estos dos ADN, podemos entender lo que vino antes de la ‘mutación’. A menudo, en un tumor, que está adquiriendo mutaciones como sello distintivo de la enfermedad, podemos encontrar evidencia de que algunas células han adquirido mutaciones muy tempranas, y otras que continuaron obteniendo mutaciones en esa misma región de ADN que no están presentes en todos los tumores. células. Hay un curso de tiempo para estas mutaciones que se puede determinar de tal manera que, en comparación con la referencia, qué mutaciones más antiguas se fijaron en la región mutada antes de las mutaciones más recientes.

Si sospecháramos que la referencia era una mutación de lo que contribuyeron los padres, podríamos usar las muestras somáticas parentales para ese organismo para determinar si la mutación existió en la generación anterior. Esto continuaría más allá de los familiares anteriores para determinar con la presente ‘mutación’ vista que tenía un formulario de referencia anterior.

En microbiología, la referencia sería una muestra de la población de organismos antes de que ocurriera la sospecha de mutación, ya que la referencia pasada es simplemente establecer lo que estaba presente en el ‘pasado’, para que pueda compararse con el ‘ahora’, ya que la pregunta OP se relaciona con este cambio durante un período de tiempo. Este campo también utiliza árboles evolutivos, para determinar qué ‘mutaciones’ podrían haber surgido con el tiempo o incluso para definir qué se consideraría una mutación desde algún punto en el pasado hasta un punto posterior.

Si, en cambio, la pregunta, para reformular: “¿Se puede usar una computadora para determinar cuál debería haber sido la secuencia de ADN no mutada SIN una referencia?”, Como si naturalmente hubiera una secuencia correcta y una incorrecta, entonces la respuesta es no . La mutación es un término relativo que solo tiene significado cuando se compara con una referencia. No existe una secuencia ‘correcta’ de ADN que de alguna manera sea inherentemente óptima en todas las condiciones para que sea ‘correcta’.

Por ejemplo, lo que se ve en el pasado como una secuencia “correcta” de referencia para un gen en particular, es en sí misma una forma mutante de una forma “correcta” anterior. Esta idea de mutantion solo puede entenderse si uno ha definido una referencia de lo que ha cambiado la nueva forma.

Puede suponer una serie de posibilidades dependiendo del tamaño de la muestra y los códigos y genes detectados a partir de PCR y sondas, luego comparando esto con los datos registrados podemos averiguar qué área está mutada. Esto tiene mucho éxito con las bacterias y parcialmente con el ADN humano. Recomiendo este artículo para una comprensión amplia Una descripción general de los métodos de detección de mutaciones en los trastornos genéticos

No, creo, de la manera que quieres decir.

Si me das un fragmento de ADN y dices “Hay una mutación en este gen humano para la mioglobina”, puedo compararlo con secuencias conocidas para ver qué tenemos la mayoría de nosotros y buscar diferencias. Entonces, si el ADN de referencia dice ATCGAGGTTGCA y el gen mutado dice ATCGAGTTGCA, puedo decir que hay una eliminación de una sola base en la posición 5, debe haber una G allí. Pero solo puedo hacer eso porque tengo la copia de referencia.

Aun así, no puedo estar seguro de tener razón: tal vez la eliminación fue una segunda mutación, precedida por la sustitución de C por G. Puede hacer algunas suposiciones en función de si una mutación particular da como resultado un gen “funcional” o no se basa en nuestra comprensión del “vocabulario y gramática” de genes / proteínas, pero nunca se puede estar seguro.

Como analogía, imagina que te pido que leas un libro de prueba y encuentras la oración “El cit ha sido pintado de azul pero el blanco original todavía se muestra en algunos lugares”. La oración original más probable se refiere a un catre, en lugar de un cit, especialmente si las oraciones cercanas se refieren a un bebé o una guardería. Pero podría referirse a la mutilación de un gato, a la decoración de un pozo.