Un promotor se considera débil o fuerte según la afinidad por la ARN polimerasa y el factor sigma. Esto significa que la secuencia de consenso del promotor debe coincidir con la de la ARN polimerasa. Si no coincide exactamente, podemos decir que el promotor es débil. Un promotor débil proporciona baja transcripción y, por lo tanto, bajos niveles de producto proteico. Ahora debería haber razones por las cuales se encuentran promotores tanto débiles como fuertes en la naturaleza. Es porque la naturaleza no quiere que ciertos genes estén activos todo el tiempo. Un promotor fuerte produce muchos productos génicos que resultan en una carga metabólica significativa. Y la célula tiene que encontrar más recursos y es difícil. Esto no favorecerá al organismo en la selección natural y es por eso que los promotores débiles son de naturaleza obvia.
Una forma de saber si un promotor es fuerte o débil es mediante el uso de un gen informador. Los genes informadores cuando se agregan dan un efecto fenotípico cuantificable.
Un ejemplo de promotor débil y fuerte son el promotor del operón lac y el promotor del gen represor lac respectivamente. El operón lac es fuerte ya que necesita producir más b-galactosidasa para descomponer la lactosa. Ahora el gen represor lac se asegura de que la proteína represora se produzca cuando la lactosa no está presente. Esta proteína inactivará el operón lac.
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Los promotores virales son buenos. Pero los onss más utilizados son los vectores plasmídicos. Los promotores virales se pueden usar en casi todas partes. Es estable bajo una amplia gama de organismos.
